Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOJQ9H4E5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOJQ9H4E5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOJQ9H4E5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms