Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC68Q9H2F9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC68Q9H2F9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC68Q9H2F9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms