Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
B3GNT4Q9C0J1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
B3GNT4Q9C0J1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
B3GNT4Q9C0J1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms