Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2OQ9C0C9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2OQ9C0C9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms