Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.722e-7■■■■■ 27.3
FTOQ9C0B1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 324.3■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 424.3■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 320.86■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 220.44■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 519.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 219.16■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.951e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 423.6■■□□□ 1.371e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)21.49■■□□□ 1.031e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 320.36■□□□□ 0.851e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 218.21■□□□□ 0.511e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 318.08■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 317.93■□□□□ 0.461e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -01e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 414.35□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 27.2
FTOQ9C0B1 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 49.16□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 27.1
FTOQ9C0B1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.182e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.922e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 27
FTOQ9C0B1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 31e-8■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 316.99■□□□□ 0.319e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 MYO10-212ENST00000515803 4839 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 MYO10-203ENST00000505695 4803 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 HSP90AB2P-202ENST00000602906 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.89e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC9.08□□□□□ -0.969e-7■■■■□ 26.7
FTOQ9C0B1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 26.6
FTOQ9C0B1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-9■■■■□ 26.3
FTOQ9C0B1 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 411.39□□□□□ -0.591e-7■■■■□ 26.3
FTOQ9C0B1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 26.2
FTOQ9C0B1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-10■■■■□ 26.1
FTOQ9C0B1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.454e-10■■■■□ 26
FTOQ9C0B1 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-10■■■■□ 26
FTOQ9C0B1 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 26
FTOQ9C0B1 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 26
FTOQ9C0B1 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)26.43■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 25.9
FTOQ9C0B1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25.9
FTOQ9C0B1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 25.9
FTOQ9C0B1 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 25.9
FTOQ9C0B1 DGAT1-207ENST00000531896 981 ntTSL 328.21■■■□□ 2.119e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 MVD-212ENST00000565842 285 ntTSL 327.82■■■□□ 2.049e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.979e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 MVD-204ENST00000562741 217 ntTSL 224.81■■□□□ 1.569e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 DGAT1-204ENST00000525371 840 ntTSL 523.81■■□□□ 1.49e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.071e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-203ENST00000527154 571 ntTSL 219.33■□□□□ 0.681e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 318.78■□□□□ 0.69e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.599e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.541e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.159e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.19e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 214.3□□□□□ -0.129e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.159e-9■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-206ENST00000533011 733 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-205ENST00000531158 563 ntTSL 410.8□□□□□ -0.681e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 26.86□□□□□ -1.311e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 CHMP4A-208ENST00000534106 370 ntTSL 53.62□□□□□ -1.831e-12■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.912e-6■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 25.8
FTOQ9C0B1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.769e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.129e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-205ENST00000457606 769 ntTSL 520.53■□□□□ 0.889e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-209ENST00000489079 557 ntTSL 310.85□□□□□ -0.679e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-204ENST00000431660 1418 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.879e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.979e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-207ENST00000486860 1024 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.269e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-208ENST00000488015 588 ntTSL 25.39□□□□□ -1.559e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.929e-10■■■■□ 25.7
FTOQ9C0B1 CANX-214ENST00000508787 568 ntTSL 34.02□□□□□ -1.774e-6■■■■□ 25.6
FTOQ9C0B1 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 52.54□□□□□ -24e-6■■■■□ 25.6
FTOQ9C0B1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.967e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 C8orf82-205ENST00000534680 1637 ntTSL 526.82■■□□□ 1.887e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.747e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.77e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.517e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.517e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 324.22■■□□□ 1.477e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.477e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.327e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SCAF8-204ENST00000461219 677 ntTSL 523.26■■□□□ 1.317e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 521.64■■□□□ 1.057e-6■■■■□ 25.5
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