Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM4Q9C037 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM4Q9C037 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM4Q9C037 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM4Q9C037 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM4Q9C037 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM4Q9C037 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms