Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM9Q9C026 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM9Q9C026 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM9Q9C026 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms