Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSX2Q9BZM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSX2Q9BZM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSX2Q9BZM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms