Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP3Q9BZ76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP3Q9BZ76 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms