Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM55Q9BYV6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM55Q9BYV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms