Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK3Q9BYB0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK3Q9BYB0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK3Q9BYB0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHANK3Q9BYB0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHANK3Q9BYB0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms