Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLDIP3Q9BY77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLDIP3Q9BY77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLDIP3Q9BY77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms