Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN1Q9BY11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PACSIN1Q9BY11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACSIN1Q9BY11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN1Q9BY11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms