Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4Q9BWF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4Q9BWF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4Q9BWF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms