Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM2Q9BVW6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.4 ms