Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUSC1Q9BVN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUSC1Q9BVN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUSC1Q9BVN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUSC1Q9BVN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUSC1Q9BVN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUSC1Q9BVN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms