Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPPD1Q9BV87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPPD1Q9BV87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms