Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FSD1Q9BTV5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FSD1Q9BTV5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FSD1Q9BTV5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FSD1Q9BTV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FSD1Q9BTV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FSD1Q9BTV5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms