Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM43Q9BTV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM43Q9BTV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM43Q9BTV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms