Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBM42Q9BTD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RBM42Q9BTD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RBM42Q9BTD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RBM42Q9BTD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms