Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTA3Q9BTC8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTA3Q9BTC8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MTA3Q9BTC8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTA3Q9BTC8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms