Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPK3BQ9BT76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPK3BQ9BT76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms