Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF25Q9BQ70 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF25Q9BQ70 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF25Q9BQ70 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF25Q9BQ70 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF25Q9BQ70 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms