Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF15Q99988 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF15Q99988 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF15Q99988 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms