Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTRCQ99895 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTRCQ99895 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTRCQ99895 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTRCQ99895 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms