Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF2Q99805 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF2Q99805 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF2Q99805 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms