Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC6Q99741 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC6Q99741 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC6Q99741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms