Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNKPQ96T60 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNKPQ96T60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNKPQ96T60 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms