Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC22A12Q96S37 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC22A12Q96S37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A12Q96S37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A12Q96S37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC22A12Q96S37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms