Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERGIC2Q96RQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms