Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST4Q96RP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAL3ST4Q96RP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST4Q96RP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAL3ST4Q96RP7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms