Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CICQ96RK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CICQ96RK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CICQ96RK0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
CICQ96RK0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CICQ96RK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms