Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3IPQ96QF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IPQ96QF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IPQ96QF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms