Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RILPQ96NA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RILPQ96NA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms