Protein–RNA interactions for Protein: Q96ME1

FBXL18, F-box/LRR-repeat protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL18Q96ME1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXL18Q96ME1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXL18Q96ME1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXL18Q96ME1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXL18Q96ME1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXL18Q96ME1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXL18Q96ME1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXL18Q96ME1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXL18Q96ME1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms