Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL15Q96M94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL15Q96M94 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms