Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C4orf36Q96KX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf36Q96KX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms