Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R13BQ96KQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP1R13BQ96KQ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R13BQ96KQ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R13BQ96KQ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R13BQ96KQ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms