Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNIP3Q96KP6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNIP3Q96KP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNIP3Q96KP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNIP3Q96KP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms