Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GJD4Q96KN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GJD4Q96KN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GJD4Q96KN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
GJD4Q96KN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms