Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COX4I2Q96KJ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX4I2Q96KJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms