Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS50Q96JG6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS50Q96JG6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS50Q96JG6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS50Q96JG6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms