Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC22AQ96IW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC22AQ96IW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms