Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHDQ96IW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHDQ96IW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHDQ96IW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms