Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX3

WDR34, WD repeat-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34Q96EX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR34Q96EX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR34Q96EX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR34Q96EX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR34Q96EX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms