Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP4CQ96CF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP4CQ96CF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHMP4CQ96CF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP4CQ96CF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms