Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFHD2Q96C19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.4 ms