Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD2Q96BF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD2Q96BF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms