Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC8Q96B26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC8Q96B26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC8Q96B26 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms