Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX21Q969T3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX21Q969T3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SNX21Q969T3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX21Q969T3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms